OpenBioLink：面向大规模生物医学链接预测的基准框架
人工智能
2022-04-06 v2 信息检索
摘要
摘要：近来，新颖的机器学习算法已展现出预测生物医学知识网络中未发现链接的潜力。然而，用于衡量算法进展的专用基准尚未出现。我们提出 OpenBioLink，这是一个大规模、高质量且极具挑战性的生物医学链接预测基准，用于透明且可复现地评估此类算法。此外，我们给出了初步的基线评估结果。可用性与实现：源代码、数据与补充文件已在 https://github.com/OpenBioLink/OpenBioLink 公开提供。联系方式：matthias.samwald（at）meduniwien.ac.at
引用
@article{arxiv.1912.04616,
title = {OpenBioLink: A benchmarking framework for large-scale biomedical link prediction},
author = {Anna Breit and Simon Ott and Asan Agibetov and Matthias Samwald},
journal= {arXiv preprint arXiv:1912.04616},
year = {2022}
}