关于字符串核预像问题及其在药物发现中的应用
机器学习
2014-12-05 v2 计算工程、金融与科学
摘要
预像问题必须在大多数结构化输出预测器的推理过程中解决。对于字符串核，该问题对应于找到与给定输入相关联的字符串。能够解决或找到该问题良好近似的算法将在计算生物学和其他领域有许多应用。本文利用基于字符串核的线性预测器组合优化的最新结果，为预像问题开发了一个适用于许多字符串核的低复杂度上界。该上界成功用于分支定界搜索算法。介绍并讨论了在可药物肽发现中的应用和结果。
引用
@article{arxiv.1412.1463,
title = {On the String Kernel Pre-Image Problem with Applications in Drug Discovery},
author = {Sébastien Giguère and Amélie Rolland and François Laviolette and Mario Marchand},
journal= {arXiv preprint arXiv:1412.1463},
year = {2014}
}
备注
Peer-reviewed and accepted for presentation at Machine Learning in Computational Biology 2014, Montr\'eal, Qu\'ebec, Canada