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NPB-REC:基于欠采样数据的深度学习 MRI 重建中不确定性的非参数评估

图像与视频处理 2022-08-09 v1 计算机视觉与模式识别

摘要

基于深度学习(DL)的图像重建模型中不确定性量化,对于基于重建图像进行可靠临床决策至关重要。我们引入“NPB-REC”,一种用于欠采样“k空间”数据 MRI 重建不确定性评估的非参数全贝叶斯框架。我们在训练阶段使用随机梯度朗之万动力学(SGLD)来刻画网络权重的后验分布。我们在来自 fastmri 挑战赛的多线圈脑 MRI 数据集上展示了我们方法相对于基线 E2E-VarNet(含与不含推理时 dropout)的附加价值。我们的实验表明,在高加速率(R=8R=8)下,NPB-REC 在重建精度上优于基线(PSNR 和 SSIM 为 34.5534.550.9080.908 对比 33.0833.080.8970.897p<0.01p<0.01)。这在临床标注区域中也得到度量。更重要的是,与蒙特卡洛推理时 Dropout 方法相比,它提供了与重建误差相关性更高的不确定性估计(皮尔逊相关系数为 R=0.94R=0.94 对比 R=0.91R=0.91)。所提方法有望促进基于 DL 的欠采样数据 MRI 重建方法的安全应用。代码与训练模型可在 \url{https://github.com/samahkh/NPB-REC} 获取。

关键词

引用

@article{arxiv.2208.03966,
  title  = {NPB-REC: Non-parametric Assessment of Uncertainty in Deep-learning-based MRI Reconstruction from Undersampled Data},
  author = {Samah Khawaled and Moti Freiman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2208.03966},
  year   = {2022}
}

备注

To appear in the proceedings of the International Workshop on Machine Learning for Medical Image Reconstruction (MLMIR 2022), https://sites.google.com/view/mlmir2022