NOVA：用于自动组织病理分析与发现的智能体框架
计算与语言
2025-11-17 v1 人工智能
摘要
数字组织病理分析涉及复杂且耗时的工作流程和专业知识，限制了其可及性。我们引入NOVA，一个智能体框架，通过迭代生成和运行 Python 代码将科学查询转化为可执行的分析管道。NOVA集成了49个领域特定工具（例如细胞核分割、整块切片编码），并可针对性地创建新的工具。为评估此类系统，我们提出SlideQuest—a由病理学家和生物医学科学家验证的90题基准——涵盖数据处理、定量分析和假设检验。与先前以知识记忆或诊断问答为中心的生物医学基准不同，SlideQuest要求进行多步推理、迭代编码和计算问题解决。定量评估表明，NOVA在编码智能体基线上取得优异表现，一个由病理学家验证的案例研究将形态学与与预后相关的PAM50亚型联系起来，展示了其可扩展的发现潜力。
引用
@article{arxiv.2511.11324,
title = {NOVA: An Agentic Framework for Automated Histopathology Analysis and Discovery},
author = {Anurag J. Vaidya and Felix Meissen and Daniel C. Castro and Shruthi Bannur and Tristan Lazard and Drew F. K. Williamson and Faisal Mahmood and Javier Alvarez-Valle and Stephanie L. Hyland and Kenza Bouzid},
journal= {arXiv preprint arXiv:2511.11324},
year = {2025}
}