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非均匀生长与表面摩擦决定软基底上细菌生物膜的形貌

生物物理 2020-05-05 v1 软凝聚态物质

摘要

在发育过程中,生物体获得具有重要生理后果的三维形状。尽管真核生物形态发生的基本机制已知,但在体内往往难以操控。为规避此问题,本文展示了一项在琼脂基底上培养霍乱弧菌(Vibrio cholerae)生物膜的研究,其中通过调节琼脂浓度改变了时空形态模式。扩张中的生物膜初始为平坦状,随后经历力学失稳并产生褶皱。周边区域发育出有序的放射状条纹,而中心区域则呈现之字形人字纹状褶皱模式。依据琼脂浓度不同,褶皱最初出现于周边区域并向内传播(低琼脂浓度),或出现于中心区域并向外传播(高琼脂浓度)。为理解这些实验观测,我们建立了一个模型,考虑营养物质的扩散及其被细菌摄取、细菌生长/生物膜基质产生、生物膜与琼脂的力学形变以及二者间的摩擦。我们的模型表明,生物膜中心区域下方营养耗竭导致径向依赖的生长分布,进而产生各向异性应力,决定了褶皱的形貌。此外,我们预测增大表面摩擦(琼脂浓度)会降低应力各向异性,并将最大压应力(褶皱失稳首次发生处)的位置移向生物膜中心,与实验观测一致。我们的结果广泛适用于具有类似形貌的细菌生物膜,并为其他细菌生物膜如何形成独特褶皱模式提供了见解。

关键词

引用

@article{arxiv.1910.14645,
  title  = {Non-uniform growth and surface friction determine bacterial biofilm morphology on soft substrates},
  author = {Chenyi Fei and Sheng Mao and Jing Yan and Ricard Alert and Howard A. Stone and Bonnie L. Bassler and Ned S. Wingreen and Andrej Kosmrlj},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1910.14645},
  year   = {2020}
}

备注

16 pages, 4 figures + supplementary information (36 pages, 14 figures)