小分子数下生化信号循环中的噪声与临界现象
分子网络
2013-05-29 v4
摘要
活细胞中的生化反应网络通常涉及信号分子的可逆共价修饰,例如蛋白质磷酸化。在小分子数条件下(这在活细胞中经常发生),质量作用理论无法描述此类系统的动力学。相反,生化反应必须被视为随机过程,这些过程内在产生化学物质的浓度涨落。我们通过解析建模和浓度时间涨落的数值精确蒙特卡洛模拟,研究了共价修饰循环的随机反应动力学。根据参数区域,我们发现浓度概率密度函数在定性上不同的分布函数类别,包括具有分数且可调指数的幂律分布。这些发现挑战了将生化控制网络视为确定性计算系统的传统观点,并表明细胞中的共价修饰循环可以作为多功能且可调的噪声发生器。
引用
@article{arxiv.0904.0947,
title = {Noise and critical phenomena in biochemical signaling cycles at small molecule numbers},
author = {C. Metzner and M. Sajitz-Hermstein and M. Schmidberger and B. Fabry},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.0947},
year = {2013}
}
备注
11 pages, 8 figures, needs style files: revTex, chemarrow