由计算系统生物学进行数字孪生的体内代谢组学 NMR 显微技术需要提升灵敏度
定量方法
2017-07-28 v1
摘要
生物体的代谢在细胞水平受到调节，但也受到其环境的强烈影响。对活体生物的精确代谢组学研究目前受到测量灵敏度的阻碍：大多数代谢组学测量技术都涉及某种妥协，即要么在远大于单个细胞的体积上进行平均，要么需要侵入生物体，要么中止生物体的状态。NMR 是一种本质上非侵入式的化学计量与成像方法，因此原则上适合进行代谢组学测量。代谢组学的数字孪生是计算系统生物学，因此 NMR 显微技术有望成为一种将生物体代谢组学和行为反应的理论与实验探索相结合的可行方法。这篇展望论文探讨了在小型生物 C. elegans 上进行基于 NMR 的体内代谢组学所面临的挑战，指明了利用 MEMS 技术创造可能解决方案的途径，并强调了目前尚无法克服的困难。
引用
@article{arxiv.1707.08726,
title = {NMR microscopy for in vivo metabolomics, digitally twinned by computational systems biology, needs a sensitivity boost},
author = {Jan G. Korvink and Vlad Badilita and Lorenzo Bordonali and Mazin Jouda and Dario Mager and Neil MacKinnon},
journal= {arXiv preprint arXiv:1707.08726},
year = {2017}
}
备注
9 pages, 2 figures, Perspective