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多示例神经影像 Transformer

计算机视觉与模式识别 2023-11-27 v1 机器学习

摘要

我们首次提出使用基于多示例学习且无卷积的 transformer 模型,称为多示例神经影像 Transformer(MINiT),用于 T1 加权(T1w)MRI 的分类。我们首先提出几种适用于神经影像的 transformer 模型变体。这些模型从输入体数据中提取非重叠的 3D 块,并对其线性投影的序列执行多头自注意力。另一方面,MINiT 将输入 MRI 的每个非重叠 3D 块视为其自身的实例,进一步将其拆分为非重叠的 3D 小块,并在其上计算多头自注意力。作为概念验证,我们通过训练模型从两个公共数据集——青少年脑认知发育(ABCD)与全国酒精与神经发育青春期联盟(NCANDA)——的 T1w-MRI 中识别性别来评估我们模型的有效性。学习到的注意力图突出了有助于识别脑形态测量中性别差异的体素。代码可在 https://github.com/singlaayush/MINIT 获取。

关键词

引用

@article{arxiv.2208.09567,
  title  = {Multiple Instance Neuroimage Transformer},
  author = {Ayush Singla and Qingyu Zhao and Daniel K. Do and Yuyin Zhou and Kilian M. Pohl and Ehsan Adeli},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2208.09567},
  year   = {2023}
}