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MRPC:一个用于精确推断因果图的R包

机器学习 2018-06-07 v1 机器学习

摘要

我们提出MRPC,一个在推断精度上优于现有包(如pcalg和bnlearn)的R包,用于学习因果图。我们的算法建立在强大的PC算法之上,后者是计算机科学中用于学习有向无环图的经典算法。精度的提升源于对错误发现率(FDR)的在线控制以减少假阳性边、更准确地识别v-结构(即T1T2T3T_1 \rightarrow T_2 \leftarrow T_3)的方法,以及对节点间相关矩阵的稳健估计。对于包含每个样本基因型和基因表达的基因组数据,MRPC引入孟德尔随机化原理来确定边的方向。我们的包可应用于连续型和离散型数据。

关键词

引用

@article{arxiv.1806.01899,
  title  = {MRPC: An R package for accurate inference of causal graphs},
  author = {Md. Bahadur Badsha and Evan A Martin and Audrey Qiuyan Fu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1806.01899},
  year   = {2018}
}