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MouseGAN++:用于小鼠脑多 MRI 模态合成与结构分割的无监督解耦与对比表示

图像与视频处理 2022-12-06 v1 计算机视觉与模式识别

摘要

在磁共振(MR)图像上分割小鼠脑精细结构对于描绘形态区域、分析脑功能及理解其关系至关重要。与单一 MRI 模态相比,多模态 MRI 数据提供互补的组织特征,可被深度学习模型利用,从而获得更好的分割结果。然而,多模态小鼠脑 MRI 数据常常缺失,使得小鼠脑精细结构的自动分割成为一项极具挑战的任务。为解决此问题,有必要融合多模态 MRI 数据以在不同脑结构中产生显著对比。因此,我们提出了一种新颖的基于解耦与对比 GAN 的框架,名为 MouseGAN++,以结构保持的方式从单模态合成多模态 MR 图像,从而通过填补缺失模态与多模态融合来提升分割性能。我们的结果表明,本方法的转换性能优于最先进(state-of-the-art)方法。利用随后学习的模态不变信息以及模态转换图像,MouseGAN++ 可分割精细脑结构,平均 Dice 系数分别为 90.0%(T2w)与 87.9%(T1w),相较最先进算法实现约 +10% 的性能提升。我们的结果表明,MouseGAN++ 作为一种同步图像合成与分割方法,可用于以非配对方式融合跨模态信息,并在缺失多模态数据时产生更鲁棒的性能。我们将本方法作为小鼠脑结构分割工具发布供学术免费使用:https://github.com/yu02019。

关键词

引用

@article{arxiv.2212.01825,
  title  = {MouseGAN++: Unsupervised Disentanglement and Contrastive Representation for Multiple MRI Modalities Synthesis and Structural Segmentation of Mouse Brain},
  author = {Ziqi Yu and Xiaoyang Han and Shengjie Zhang and Jianfeng Feng and Tingying Peng and Xiao-Yong Zhang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2212.01825},
  year   = {2022}
}

备注

IEEE Transactions on Medical Imaging (IEEE-TMI) 2022