内含子内重组的蒙特卡洛模拟
种群与进化
2009-11-11 v1
摘要
生物基因组分为编码区与非编码区。内含子是基因内的非编码部分，而其余非编码部分为基因间序列。为研究内含子内重组的进化意义，我们采用了两种基于蒙特卡洛方法的模型。在计算机模拟中，我们通过声明外显子间重组的概率实现了基因的内部结构。内含子内重组具有优势的一种情形是：在长时期无基因功能选择后，通过组合散布于种群基因库中的合适外显子来恢复功能基因。此时种群须经历瓶颈。这些事件相当罕见，我们曾预期应存在其他从内含子内重组获益的现象。事实上我们发现，内含子内重组仅在重组后除重组型外亲本单倍型可用且选择已作用于配子的情况下才具有优势。
引用
@article{arxiv.q-bio/0511010,
title = {Monte Carlo simulations of the inside-intron recombination},
author = {Stanislaw Cebrat and Andrzej Pekalski and Fabian Scharf},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0511010},
year = {2009}
}
备注
12 pages inc. 5 Figs., for Int. J. Mod. Phys. C 17, issue 4 (2006)