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用增量机器学习建模COVID-19病毒演化

机器学习 2021-04-22 v2 机器学习

摘要

投入时间和资源以开发更好的策略和方法来应对潜在大流行,对于未来处理新变异株或其他病毒的潜在爆发至关重要。在这项工作中,我们重现了一年前(2020年)的场景,即COVID-19疫情在报告病例数最多的五十个国家中席卷全球。我们进行了一些实验,将最先进的机器学习算法(如LSTM)与在线增量机器学习算法进行比较,以使它们适应疾病传播的每日变化并预测未来的COVID-19病例。为比较这些方法,我们进行了三项实验:在第一项中,我们仅使用所预测国家的数据训练模型。在第二项中,我们使用所有五十个国家的数据训练并预测其中每一个。在第一和第二项实验中,我们对所有方法采用静态保留(hold-out)方案。在第三项实验中,我们使用预序评估(prequential evaluation)依次训练增量方法。该方案对大多数最先进的机器学习算法并不适用,因为它们需要对每批预测从头重新训练,造成计算负担。结果表明,增量方法是适应疾病随时间变化的有前景的途径;它们始终与数据分布的最新状态保持同步,并且比其他技术(如LSTM)的计算成本显著更低。

关键词

引用

@article{arxiv.2104.09325,
  title  = {Modelling the COVID-19 virus evolution with Incremental Machine Learning},
  author = {Andrés L. Suárez-Cetrulo and Ankit Kumar and Luis Miralles-Pechuán},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2104.09325},
  year   = {2021}
}