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体外丝状伪足形成的建模

亚细胞过程 2010-05-14 v2 软凝聚态物质 定量方法

摘要

丝状伪足是肌动蛋白丝的束状结构,它们从爬行细胞的前缘向前延伸,以探测即将到来的环境。体外实验[D. Vignjevic等人,《细胞生物学杂志》第160卷,951页(2003年)]确定了从前缘的树突状形态形成丝状伪足所需的最少成分。我们使用描述生长中的束尖密度的动力学聚集方程对这些实验进行建模。在平均场中,我们确定束尺寸分布在小于特征束尺寸时是宽的,超过该特征尺寸后分布呈指数衰减。结合了成束和交联的二维模拟测量到的束尺寸分布与平均场定性一致。模拟还展示了树突区域径向范围随加帽蛋白浓度的非单调变化,正如实验中所观察到的,这是由于渗流和生长中的丝状体在球形障碍物上的棘轮效应之间的相互作用所致。

关键词

引用

@article{arxiv.0909.2594,
  title  = {Modeling the formation of in vitro filopodia},
  author = {K. -C. Lee and A. Gopinathan and J. M. Schwarz},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0909.2594},
  year   = {2010}
}

备注

22 pages, 16 figures