生化动力学实验的建模、模拟与参数拟合
定量方法
2015-08-24 v1
摘要
在许多化学和生物学应用中，包含未知参数的微分方程组被用来解释经验观察和实验数据。这些微分方程通常是非线性的且难以分析，需要数值方法来近似求解。加剧这一困难的是微分方程组中的未知参数，必须为它们赋予特定的数值才能运行模拟。以雌激素受体蛋白二聚化为例，演示了模型构建、简化、模拟和参数估计。将数学、计算和统计方法应用于经验数据，以推导动力学参数估计值，并指导有关未来实验和建模的决策。所演示的过程作为一个教学示例，展示了用于从生化数据模型中提取参数值的定量方法。
引用
@article{arxiv.1508.05359,
title = {Modeling, Simulating, and Parameter Fitting of Biochemical Kinetic Experiments},
author = {D. Goulet},
journal= {arXiv preprint arXiv:1508.05359},
year = {2015}
}
备注
23 pages, 9 figures, to be published in SIAM Review