基于新结构信息建模细菌鞭毛马达：两个相互作用蛋白质纳米环的旋转动力学
软凝聚态物质
2022-02-15 v1 生物大分子
亚细胞过程
摘要
本文基于最近发现的定子复合物（MotAMotB）结构，建立了旋转式细菌鞭毛马达（BFM）的数学模型。该结构表明定子也会旋转。BFM 被建模为两个相互旋转的纳米环。具体而言，质子通过定子复合物的转运驱动 MotA 五聚体环旋转，进而通过定子 MotA 环与转子 FliG 环之间的相互作用驱动转子中的 FliG 环旋转。该结构信息模型的初步结果与观测到的转矩-转速关系一致。更重要的是，该模型预测了独特的转子与定子动力学及其对负载的依赖性，这可由未来的实验进行检验。本文还讨论了验证和改进该模型以进一步理解 BFM 中转矩产生的分子机制的可能途径。
引用
@article{arxiv.2202.05890,
title = {Modeling bacterial flagellar motor with new structure information: Rotational dynamics of two interacting protein nano-rings},
author = {Yuansheng Cao and Tairan Li and Yuhai Tu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.05890},
year = {2022}
}