MiShape：显微图像中线粒体的三维形状建模
图像与视频处理
2023-03-06 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
荧光显微镜是观察细胞并理解所有生物维持生命过程潜在机制的必备工具。由于线粒体表达出复杂多样的形状以及这些显微镜分辨率有限，从荧光显微图像中提取线粒体三维形状的问题仍未解决。我们提出一种方法，通过利用高分辨率电子显微镜数据学习称为MiShape的线粒体形状先验来弥补这一差距。MiShape是使用线粒体形状的隐式表示学习的生成模型。它提供一种形状分布，可用于生成无限逼真的线粒体形状。我们展示了MiShape的表示能力及其在给定单张二维荧光图像或少量二维切片的三维堆叠时进行三维形状重建的效用。我们还通过推导具有逼真三维真值的模拟荧光显微镜数据集来展示我们方法的应用，用于二维分割与显微镜间变换问题。
引用
@article{arxiv.2303.01546,
title = {MiShape: 3D Shape Modelling of Mitochondria in Microscopy},
author = {Abhinanda R. Punnakkal and Suyog S Jadhav and Alexander Horsch and Krishna Agarwal and Dilip K. Prasad},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.01546},
year = {2023}
}