MiCellAnnGELo：利用3D虚拟现实标注复杂细胞表面的显微时间序列
人机交互
2022-12-12 v2
摘要
摘要：3D 活细胞显微技术的进展使得以前未观察到的过程得以高分辨率捕获。然而，由于难以手动标注 3D 训练数据，释放现代机器学习方法的力量以充分利用这些技术受到了阻碍。MiCellAnnGELo 虚拟现实软件提供了一个用于查看和交互 4D 显微数据的沉浸式环境，包括高效的标注工具。我们提出了标注细胞表面的工具，具有广泛的应用，包括细胞运动、内吞作用和跨膜信号传导。可用性与实现：MiCellAnnGELo 采用跨平台（Mac/Unix/Windows）的 Unity 游戏引擎，并在 MIT 许可下发布于 https://github.com/CellDynamics/MiCellAnnGELo.git，同时提供示例数据和演示视频。MiCellAnnGELo 可在 2D 屏幕上的桌面模式运行，也可在使用兼容 GPU 的标准 VR 头显的 3D 模式下运行。
引用
@article{arxiv.2209.11672,
title = {MiCellAnnGELo: Annotate microscopy time series of complex cell surfaces with 3D Virtual Reality},
author = {Adam Platt and E. Josiah Lutton and Edward Offord and Till Bretschneider},
journal= {arXiv preprint arXiv:2209.11672},
year = {2022}
}
备注
For associated code and sample data, see https://github.com/CellDynamics/MiCellAnnGELo.git