基于三维卷积神经网络集成与解剖先验引导的纵隔淋巴结分割
图像与视频处理
2022-05-03 v1 计算机视觉与模式识别
机器学习
医学物理
摘要
随着肺癌的发展,必须评估肿大且可能恶性的淋巴结的存在,以正确估计疾病进展并选择最佳治疗策略。遵循临床指南,短轴直径和纵隔分站的估计对于正确诊断至关重要。因此,一种准确且自动的分割方法对于定量描述淋巴结具有决定性意义。本研究探讨了三维卷积神经网络的使用,无论是通过切片式方案还是利用下采样的整体体积。此外,还考虑了简单集成策略的潜在影响。由于淋巴结与邻近解剖结构具有相似的衰减值,我们建议利用其他器官的知识作为先验信息来引导分割任务。为评估分割和实例检测性能,在包含120个对比增强CT体积的数据集上采用了5折交叉验证策略。对于1178个短轴直径 mm的淋巴结,我们性能最佳的方法达到了患者级召回率92%、每患者假阳性数5以及分割重叠率80.5%。该方法在各分站上表现同样良好。在集成方案中融合切片式与全体积方法产生了最佳性能。解剖先验引导策略是有前景的,然而似乎需要多于四个器官的集合才能产生最优收益。鉴于淋巴结可能表现出的广泛表达(即形状、位置和衰减)以及对比剂摄取差异,更大的数据集也是必需的。
引用
@article{arxiv.2102.06515,
title = {Mediastinal lymph nodes segmentation using 3D convolutional neural network ensembles and anatomical priors guiding},
author = {David Bouget and André Pedersen and Johanna Vanel and Haakon O. Leira and Thomas Langø},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.06515},
year = {2022}
}
备注
18 pages, 8 figures, submitted to Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging & Visualization