从自组织视角看生物系统中的测量
其他定量生物学
2017-04-03 v1
摘要
由于大量关于实验结果有限可重复性的报告，生物系统中的测量成为了一个备受关注的问题。为揭示这种不一致性的根源，我们考察了生物系统作为动力系统的普遍特征：其不仅远离化学平衡，而且在大多数情况下也远离其Lyapunov稳定态。因此，在生物实验中，我们观测到的不是状态，而是被检测生物所遵循的不同轨迹。如果选择了其中一种可能序列，便获得了整个问题的一个微小子集，有时看似高度可重复。但只有当已知所有可能轨迹的完整集合时，才知晓生物的状态。而这通常在实践中是不可能的。因此，我们提出一种不同的框架来报告和分析生物实验，尊重非线性数学的观点。该观点应用于避免过于乐观的结果，这些结果随后不得不被撤回或大幅补充。增加实验程序的规范性是更好理解生物系统可能演化的路径范围的方法。而这隐藏于实验方案的发展中。
引用
@article{arxiv.1502.02419,
title = {Measurement in biological systems from the self-organisation point of view},
author = {Dalibor Štys and Jan Urban and Renata Rychtáriková and Anna Zhyrova and Petr Císař},
journal= {arXiv preprint arXiv:1502.02419},
year = {2017}
}
备注
13 pages, 5 figures