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符号序列的映射等价性:理论与应用

信息论 2015-05-13 v1 数值分析 泛函分析 math.IT

摘要

通过将符号数据映射为数值信号来处理符号序列,是各种应用中的常用方法。这在基因组和蛋白质组序列分析中尤其流行。针对不同应用,人们提出了多种符号序列的映射方法。然而,尚不清楚符号数据的处理结果是数值映射的人为产物,还是符号数据本身的固有属性。这个问题在工程和科学文献中长期被忽视。符号信号处理中获得的许多结果,可能只是映射的副产品,并不能揭示数据中蕴含的底层属性。此外,在许多应用中,由于用于符号数据数值表示的映射选择不同,可能会得出相互矛盾的结论。在本文中,我们提出了一个用于分析符号数据数值表示映射等价性的新框架。我们提出了强等价性和弱等价性性质,并利用信号相关性来刻画等价映射。我们推导了理论结果,建立了符号数据数值映射之间一致性的条件。此外,我们为符号序列引入了一个抽象映射模型,并将等价性的概念扩展到代数框架中。最后,我们通过将其应用于 DNA 序列分析来展示我们的理论结果。

关键词

引用

@article{arxiv.0906.2032,
  title  = {Mapping Equivalence for Symbolic Sequences: Theory and Applications},
  author = {Liming Wang and Dan Schonfeld},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0906.2032},
  year   = {2015}
}