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面向分子性质预测的局部-全局多模态对比学习

机器学习 2026-02-02 v1 人工智能

摘要

准确的分子性质预测需要整合来自分子结构和化学语义的互补信息。在这项工作中,我们提出了LGM-CL,一个局部-全局多模态对比学习框架,该框架联合建模分子图以及从SMILES和化学感知增强文本中导出的文本表示。局部官能团信息和全局分子拓扑结构分别使用AttentiveFP和图Transformer编码器捕获,并通过自监督对比学习进行对齐。此外,化学富集的文本描述与原始SMILES进行对比,以任务无关的方式融入物理化学语义。在微调过程中,通过双交叉注意力多模态融合进一步整合分子指纹。在MoleculeNet基准上的大量实验表明,LGM-CL在分类和回归任务上都取得了一致且具有竞争力的性能,验证了统一的局部-全局和多模态表示学习的有效性。

关键词

引用

@article{arxiv.2601.22610,
  title  = {Local-Global Multimodal Contrastive Learning for Molecular Property Prediction},
  author = {Xiayu Liu and Zhengyi Lu and Yunhong Liao and Chan Fan and Hou-biao Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2601.22610},
  year   = {2026}
}

备注

16 pages, 9 figures. Submitted to Briefings in Bioinformatics