LinDA：用于微生物组组成数据差异丰度分析的线性模型
统计方法学
2022-03-15 v3
摘要
差异丰度分析是微生物组数据统计分析和核心。微生物组测序数据的组成性使得错误发现率控制具有挑战性。在此，我们表明组成效应可以通过一种简单却高度灵活且可扩展的方法来解决。所提方法 LinDA 仅需要在中心对数比变换后的数据上拟合线性回归模型，并修正由组成效应引起的偏差。我们证明 LinDA 具有渐近 FDR 控制能力，并可扩展至用于相关微生物组数据的混合效应模型。通过模拟与真实实例，我们展示了 LinDA 的有效性。
引用
@article{arxiv.2104.00242,
title = {LinDA: linear models for differential abundance analysis of microbiome compositional data},
author = {Huijuan Zhou and Kejun He and Jun Chen and Xianyang Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2104.00242},
year = {2022}
}