中文

LEFM-Nets:用于冰冻切片组织病理学图像分割的可学习显式特征图深度网络

图像与视频处理 2022-04-15 v1 计算机视觉与模式识别 机器学习

摘要

医学图像的准确分割对疾病的诊断和治疗至关重要。这类问题由高度复杂的模型(如深度网络(DN))求解,需要大量标注数据用于训练。因此,许多DN具有任务或成像模态特定的架构,其决策过程往往难以解释和理解。在此,我们提出一种框架,将现有DN嵌入到由可学习显式特征图(LEFM)层诱导的低维子空间中。与现有DN相比,该框架仅增加一个超参数,且只是适度增加了可学习参数的数量。该方法旨在(但不限于)分割低维医学图像,例如染色冰冻切片的有色组织病理学图像。由于LEFM层中的特征是原始特征的多项式函数,所提出的LEFM-Nets有助于网络决策的可解释性。在本工作中,我们将LEFM与已知网络DeepLabv3+、UNet、UNet++和MA-net相结合。新的LEFM-Nets被应用于肝组织中结肠腺癌的图像分割,图像来自苏木精和伊红(H&E)染色的冰冻切片。LEFM-Nets还在来自十个正常人器官H&E染色冰冻切片图像的细胞核分割上进行了测试。在第一个问题上,LEFM-Nets在微平衡准确率和F1F_1分数方面取得了比原始网络统计显著的性能提升。在第二个问题上,LEFM-Nets相比原始网络仅取得了更好的性能。源代码可在 https://github.com/dsitnik/lefm 获取。

关键词

引用

@article{arxiv.2204.06955,
  title  = {LEFM-Nets: Learnable Explicit Feature Map Deep Networks for Segmentation of Histopathological Images of Frozen Sections},
  author = {Dario Sitnik and Ivica Kopriva},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2204.06955},
  year   = {2022}
}

备注

9 pages, 4 figures, 1 table