LAGE：一个从大规模连续表达数据重构基因调控网络的 Java 框架
机器学习
2012-11-12 v1 计算工程、金融与科学
定量方法
机器学习
摘要
LAGE 是一个用 Java 开发的系统化框架。LAGE 的动机是为从连续基因表达数据中重构极大量基因的基因调控网络 (GRNs) 提供可扩展且并行的解决方案。我们框架的基本思想源于分治法哲学。具体而言，LAGE 递归地将基因划分为多个重叠的、规模小得多的社区，分别学习社区内的 GRN，然后将它们合并。此外，重叠社区的完整信息作为副产品，可用于挖掘生物网络中有意义的功能模块。
引用
@article{arxiv.1211.2073,
title = {LAGE: A Java Framework to reconstruct Gene Regulatory Networks from Large-Scale Continues Expression Data},
author = {Yang Lu and Mengying Wang and Kenny Q. Zhu and Bo Yuan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1211.2073},
year = {2012}
}
备注
2 pages