从组织病理补丁推断描述文本
图像与视频处理
2022-02-09 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
计算组织病理学在过去几年中取得了显著进展，正逐步接近临床采用。其中一个有益方向是从H&E染色的全切片图像自动生成诊断报告，这将进一步提高病理医生常规诊断工作流程的效率。在本研究中，我们编译了一个胃腺癌内镜活检标本的组织病理描述文本数据集(PatchGastricADC22)，该数据集从诊断报告中提取并与关联全切片图像中提取的补丁配对。该数据集包含多种胃腺癌亚型。我们训练了一个基于注意力的基线模型，从补丁提取的特征预测描述文本，并获得了有前景的结果。我们公开了包含26.2万补丁的带描述文本数据集。
引用
@article{arxiv.2202.03432,
title = {Inference of captions from histopathological patches},
author = {Masayuki Tsuneki and Fahdi Kanavati},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.03432},
year = {2022}
}