细胞牵引力的计算机模拟预测
图像与视频处理
2019-10-17 v1 定量方法
摘要
牵引力显微镜技术（TFM）是一种用于测定生物细胞传递至底层表面张力的技术。通常，TFM 需要在含有荧光微珠的凝胶上培养细胞，随后进行微珠位移计算。我们提出了一种新方法，能够从细胞的常规荧光图像中预测这些力。利用深度学习，我们训练了一个适用于力像素回归的贝叶斯神经网络，并证明其能泛化到同一品系的不同细胞上。预测的力会连同近似不确定性一同计算，该不确定性显示了预测是否可信。使用所提出的方法有助于在计算非平凡微珠位移时估计力，并且还能释放显微镜的一个荧光通道。代码可在 \url{https://github.com/wahlby-lab/InSilicoTFM} 获取。
引用
@article{arxiv.1910.07380,
title = {In Silico Prediction of Cell Traction Forces},
author = {Nicolas Pielawski and Jianjiang Hu and Staffan Strömblad and Carolina Wählby},
journal= {arXiv preprint arXiv:1910.07380},
year = {2019}
}