使用模板从流式细胞术数据中识别急性髓系白血病的免疫表型
定量方法
2014-03-26 v1 计算工程、金融与科学
摘要
动机：我们研究基于模板的分类流程是否可用于识别具有许多亚型的异质性疾病中的免疫表型（并由此进行分类）。我们在此考虑的疾病是急性髓系白血病，它在形态学、细胞遗传学和分子水平上均具有异质性，并具有若干已知亚型。AML 的预后和治疗取决于其亚型。结果：我们将 flowMatch（先前工作中创建的用于流式细胞术数据的算法流程）应用于计算简明总结 AML 类和健康样本类的模板。我们开发了一个计分函数，该函数考虑了 AML 数据的异质性等特征，以识别对应于各种 AML 亚型（包括 APL）的免疫表型。测试集中的所有 AML 样本均以高置信度被正确分类。可用性：flowMatch 可在 www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/html/flowMatch.html 获取；专门用于 AML 免疫表型分析的程序可在 www.cs.purdue.edu/homes/aazad/software.html 获取。
引用
@article{arxiv.1403.6358,
title = {Immunophenotypes of Acute Myeloid Leukemia From Flow Cytometry Data Using Templates},
author = {Ariful Azad and Bartek Rajwa and Alex Pothen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.6358},
year = {2014}
}
备注
9 pages, 5 figures