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iMD4GC:不完全多模态数据集成以推进胃癌精确治疗反应预测与生存分析

图像与视频处理 2024-04-02 v1 计算机视觉与模式识别

摘要

胃癌(GC)是全球常见的恶性肿瘤,2020年新发病例超过100万,死亡人数达70万,位居第五大常见癌症。局部晚期胃癌(LAGC)约占GC诊断的三分之二,新辅助化疗(NACT)已成为LAGC的标准治疗。然而,NACT的有效性在不同患者间差异显著,相当一部分患者表现出治疗抵抗。无效的NACT不仅导致不良反应,还会错过最佳治疗窗口,导致生存率降低。然而,现有的多模态学习方法假设每个患者的所有模态都可用,这与临床实践的现实不符。每个患者可用模态的有限性会导致信息丢失,从而影响预测准确性。在本研究中,我们提出了一种针对胃癌的不完全多模态数据集成框架(iMD4GC),以应对不完全多模态数据带来的挑战,实现精确的反应预测和生存分析。具体来说,iMD4GC为每种模态引入了单模态注意力层以捕获模态内信息。随后,跨模态交互层探索潜在的模态间交互,并捕获跨模态的互补信息,从而实现对缺失模态的信息补偿。为了评估iMD4GC,我们收集了三个用于胃癌研究的多模态数据集:GastricRes(698例)用于反应预测,GastricSur(801例)用于生存分析,以及TCGA-STAD(400例)用于生存分析。我们的数据集规模显著大于以往研究。iMD4GC取得了令人印象深刻的性能:在GastricRes上AUC为80.2%,在GastricSur上C-index为71.4%,在TCGA-STAD上C-index为66.1%,显著优于其他对比方法。

关键词

引用

@article{arxiv.2404.01192,
  title  = {iMD4GC: Incomplete Multimodal Data Integration to Advance Precise Treatment Response Prediction and Survival Analysis for Gastric Cancer},
  author = {Fengtao Zhou and Yingxue Xu and Yanfen Cui and Shenyan Zhang and Yun Zhu and Weiyang He and Jiguang Wang and Xin Wang and Ronald Chan and Louis Ho Shing Lau and Chu Han and Dafu Zhang and Zhenhui Li and Hao Chen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2404.01192},
  year   = {2024}
}

备注

27 pages, 9 figures, 3 tables (under review)