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IGUANe:用于多中心脑部 MR 图像调和的 3D 通用 CycleGAN

计算机视觉与模式识别 2024-11-15 v4 人工智能 机器学习

摘要

在 MRI 研究中,来自多个获取站点的图像数据聚合可增大样本量,但可能引入与站点相关的变异性,阻碍后续分析的一致性。基于深度学习的图像翻译方法已成为跨站点调和 MR 图像的解决方案之一。本研究引入 IGUANe(Image Generation with Unified Adversarial Networks),一个原创的 3D 模型,利用域转换和简单风格迁移方法的优势,用于多中心脑部 MR 图像调和。IGUANe 通过集成通过 many-to-one 架构实现的多个域的训练,扩展了 CycleGAN。该基于域对的框架使能够实施采样策略,以防止与站点相关变异性和生物变异性之间的混淆。在推断期间,该模型可应用于任何图像,甚至来自未知获取站点的图像,使其成为用于调和的通用生成器。在由 11 个不同扫描仪的 T1 加权图像组成的数据集上训练的 IGUANe 在未见站点的数据上进行评估。评估包括对携带旅行主体的 MR 图像转换、维持域内 MR 图像之间两两距离的保持、与年龄和阿尔茨海默病(AD)相关的体积模式演变,以及在年龄回归和患者分类任务中的性能。与其他调和和归一化方法的比较表明,IGUANe 更好地保留了 MR 图像中的个体信息,更适合维持和强化与年龄和 AD 相关的变异性。未来的研究可进一步在其他多中心情境中评估 IGUANe,或使用相同模型或重新训练以适用于不同的图像模态。IGUANe 可在 https://github.com/RocaVincent/iguane_harmonization.git 上获取。

关键词

引用

@article{arxiv.2402.03227,
  title  = {IGUANe: a 3D generalizable CycleGAN for multicenter harmonization of brain MR images},
  author = {Vincent Roca and Grégory Kuchcinski and Jean-Pierre Pruvo and Dorian Manouvriez and Renaud Lopes},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2402.03227},
  year   = {2024}
}

备注

29 pages, 14 figures