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正常型和异常型分裂形态的乳腺癌组织学数据集(AMi-Br)

计算机视觉与模式识别 2025-03-14 v2 数据库

摘要

评估组织学肿瘤切片中分裂形态(MF)的密度,是许多肿瘤类型(包括乳腺癌)的重要预后指标。最近的研究表明,形态异常的MF(异常MF,AMF)的数量可能是乳腺癌的独立预后标准。AMF是调控细胞周期基因突变的指标,可导致肿瘤细胞染色体构型异常(染色体数目异常)。为促进基于图案识别的进一步研究,我们提供了首个公开可获取的异常型和正常MF数据集(AMi-Br)。为此,我们利用了两大流行MF数据集(MIDOG 2021 和 TUPAC),并通过三位专家的多数投票对所有MF进行了子分类。最终数据集包含3720个MF,其中832个(22.4%)为AMF,2888个(77.6%)为正常MF,涵盖所有223个肿瘤病例。我们提供基线分类实验,以Monte Carlo交叉验证和不同策略应对类别不平衡问题,探讨数据集的一致性。我们发现,在基于切片级别的数据集划分时,平均平衡准确率可达0.806,在基于患者级别的划分时,平衡准确率可达0.713。

关键词

引用

@article{arxiv.2501.04467,
  title  = {Histologic Dataset of Normal and Atypical Mitotic Figures on Human Breast Cancer (AMi-Br)},
  author = {Christof A. Bertram and Viktoria Weiss and Taryn A. Donovan and Sweta Banerjee and Thomas Conrad and Jonas Ammeling and Robert Klopfleisch and Christopher Kaltenecker and Marc Aubreville},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2501.04467},
  year   = {2025}
}