用于检测FFPE样本中体细胞突变的高灵敏度电化学DNA传感器
介观与纳米尺度物理
2022-05-10 v1 应用物理
摘要
我们提供了新型高性能无标记非法拉第型电化学阻抗DNA传感器。该DNA传感器基于结晶碳纳米管（CNT）阵列平台，采用Langmuir--Blodgett（LB）沉积技术制备。CNT阵列悬于纳米多孔阳极氧化铝（氧化铝，AOA）支撑体上。以单链（ss）19和20碱基寡核苷酸以及双链（ds）核苷酸序列作为所选分子靶标——人类KRAS（Kirsten Rat Sarcoma viral oncogene homolog）基因——的探针。基因组脱氧核糖核酸（DNA）分离自健康供体胎盘及肿瘤组织的FFPE（formalin-fixed, paraffin-embedded，福尔马林固定石蜡包埋）样本。采用拉曼光谱分析和电化学介电谱对靶标DNA进行测序。光学与电化学检测（DNA测序的变体）基于在DNA同源双链体形成后增强的屏蔽效应。我们证明此类技术非常灵敏，可检测阿托摩尔及以下浓度的DNA。结果，成功在人基因组DNA（分离自FFPE结直肠癌肿瘤组织样本）中鉴别出KRAS第2外显子、第12密码子、c.35G> A突变。
引用
@article{arxiv.2205.03874,
title = {High sensitivity electrochemical DNA sensors for detection of somatic mutations in FFPE samples},
author = {Valentina Egorova and Halina Grushevskaya and Nina Krylova and Igor Lipnevich and Egor Vaskovtsev and Andrei Babenka and Ina Anufreyonak and Siarhei Smirnov},
journal= {arXiv preprint arXiv:2205.03874},
year = {2022}
}