Helium：大规模植物谱系可视化
人机交互
2014-07-15 v1
摘要
背景：植物育种家正利用日益多样化的数据类型来识别具有理想特征的品系，以便将其推进到植物育种计划中。若要商业品种取得成功，必须维持并改进一些关键的形态和生理性状，如抗病性和产量。能够提供整合这些数据并与谱系结构相结合的计算工具，将使育种家能够更好地决定在杂交中使用哪些植物品系，以满足增加产量/生产和适应气候变化的关键需求。结果：我们利用一套庞大且独特的大麦 (H. vulgare) 实验数据开发了一个原型谱系可视化系统，并与领域专家进行了主观用户评估，以指导和推动我们称为 Helium 的交互式谱系可视化工具的开发。结论：我们表明，Helium 允许用户轻松地将多种数据类型与大型植物谱系整合在一起，提供一个集成环境供其探索谱系数据。我们还验证了用户对我们可视化工具中所采用的谱系抽象表示感到满意。
引用
@article{arxiv.1407.3692,
title = {Helium: Visualization of Large Scale Plant Pedigrees},
author = {Paul D. Shaw and Martin Graham and Jessie Kennedy and Iain Milne and David F. Marshall},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.3692},
year = {2014}
}
备注
BioVis 2014 conference