Graphnics：结合 FEniCS 与 NetworkX 模拟复杂网络中的流动
数值分析
2022-12-07 v1 数值分析
摘要
网络模型有助于低成本模拟，但需要对分支条件进行细致处理。我们在此提出 graphnics 库，它结合 FEniCS 与 NetworkX，以有限元方法便利地进行网络模拟。Graphnics 的特性包括：（i）构建于 NetworkX DiGraph 类之上的 FenicsGraph 类，其为网络构建全局网格，并提供描述其与图结构关系的 FEniCS 网格函数。（ii）展示如何使用 FenicsGraph 类组装并求解不同网络流动模型的示例模型。（iii）演示，例如如何在复杂生物网络上运行模拟。有趣的是，结果表明，建模为行波正弦波的血管运动能够驱动净血管周围流体流过动脉树，正如基于实验数据所提出的那样。
引用
@article{arxiv.2212.02916,
title = {Graphnics: Combining FEniCS and NetworkX to simulate flow in complex networks},
author = {Ingeborg G. Gjerde},
journal= {arXiv preprint arXiv:2212.02916},
year = {2022}
}
备注
This is an extended version of a software manuscript