图元相对于 node2vec 与 struc2vec 在网络对齐任务中的比较
社会与信息网络
2018-05-22 v2 物理与社会
摘要
网络嵌入旨在将网络中每个节点表示为概括该节点(扩展)网络邻域的低维特征向量。节点的特征向量可用于各种下游机器学习任务。近来,许多自动学习节点特征的嵌入方法涌现出来,例如 node2vec 和 struc2vec,它们主要用于社交网络领域的节点分类、链接预测和节点聚类等任务。也存在其他显式考察节点间连接(即节点网络邻域)的嵌入方法,例如图元(graphlets)。图元已用于网络比较、链接预测和网络聚类等许多任务,主要在计算生物学领域。尽管两类嵌入方法(node2vec/struc2vec 与图元)目标相似——将节点表示为特征向量,但尚无二者间的比较,可能是因为它们起源于不同领域。因此,在本研究中,我们将图元与 node2vec 和 struc2vec 进行比较,并在网络对齐任务中展开。在合成与真实世界生物网络的评估中,我们发现图元比 node2vec 和 struc2vec 更准确且更快。
引用
@article{arxiv.1805.04222,
title = {Graphlets versus node2vec and struc2vec in the task of network alignment},
author = {Shawn Gu and Tijana Milenkovic},
journal= {arXiv preprint arXiv:1805.04222},
year = {2018}
}