GEO-Nav：电压门控钠通道的几何数据集
生物大分子
2023-08-10 v2 图形学
摘要
电压门控钠(Nav)通道是药物设计与发现的主要靶标，因其涉及癫痫、偏头痛和共济失调等多种疾病。在这方面，进行形态学分析是全面理解其生物学功能与机制、并揭示实验观察难以捕捉的机制细节的关键步骤。尽管其治疗潜力巨大，药物设计资源仍显不足，尤其在准确而全面的几何信息方面。本文提出一个代表哺乳动物Nav通道的分子表面几何数据集。对每个结构，我们提供三种表示及若干几何度量，包括已识别通道的长度、体积和直线度。为展示GEO-Nav的有效使用，我们将其应用于两类不同方法中的两种方法：基于球体的方法和基于镶嵌的方法。
引用
@article{arxiv.2306.12348,
title = {GEO-Nav: a geometric dataset of voltage-gated sodium channels},
author = {Andrea Raffo and Ulderico Fugacci and Silvia Biasotti},
journal= {arXiv preprint arXiv:2306.12348},
year = {2023}
}