基于干预风格迁移的光学池化筛选基因级表征学习
图像与视频处理
2024-06-13 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
光学池化筛选(OPS)结合了自动化显微镜和基因扰动，系统性地以可扩展且具成本效益的方式研究基因功能。利用所得数据需要从由 OPS 获取的细胞扰动表型图像中提取具有生物学信息的表示。我们采用风格迁移方法，从通过 OPS 获取的基因扰动细胞图像中学习基因级特征表示。我们的方法在根据基因功能对基因表示进行聚类方面优于广泛使用的工程化特征，展示了其在发现潜在生物学关系方面的实用性。该方法为探索基因在健康与疾病中的作用提供了一条有前景的途径。
引用
@article{arxiv.2406.07763,
title = {Gene-Level Representation Learning via Interventional Style Transfer in Optical Pooled Screening},
author = {Mahtab Bigverdi and Burkhard Hockendorf and Heming Yao and Phil Hanslovsky and Romain Lopez and David Richmond},
journal= {arXiv preprint arXiv:2406.07763},
year = {2024}
}
备注
11 pages, 5 figures, CVPR workshop paper