G-Bean：一种基于本体图的生物医学文献检索 Web 工具
信息检索
2015-09-01 v5
摘要
目前，大多数人使用 PubMed 搜索 MEDLINE 数据库，这是生命科学和生物医学信息的重要书目信息来源。然而，PubMed 存在一些缺点，使得难以找到与用户个人意图相关的出版物，特别是对于非专家用户。为了改善 PubMed 的不足，我们开发了 G-Bean，一种基于图的生物医学搜索引擎，以更高效地搜索 MEDLINE 数据库中的生物医学文章。G-Bean 通过三项创新解决了 PubMed 的局限性：并行文档索引创建、基于本体图的查询扩展，以及基于用户搜索意图的文档检索与重排序。使用 106 个 OHSUMED 基准查询进行的性能评估表明，当使用这些查询搜索 MEDLINE 数据库时，G-Bean 返回的结果比 PubMed 更相关。对于某些 OHSUMED 查询，PubMed 甚至无法返回任何搜索结果，因为它未能从自然语言查询字符串自动生成适当的布尔查询语句。G-Bean 可通过 http://bioinformatics.clemson.edu/G-Bean/index.php 获取。G-Bean 通过基于本体图的查询扩展、自动文档索引和用户搜索意图发现解决了 PubMed 的局限性。它在从 MEDLINE 数据库查找相关文章以满足用户信息需求方面显示出显著优势。
引用
@article{arxiv.1401.1766,
title = {G-Bean: an ontology-graph based web tool for biomedical literature retrieval},
author = {James Z. Wang and Yuanyuan Zhang and Liang Dong and Lin Li and Pradip K Srimani and Philip S. Yu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1401.1766},
year = {2015}
}
备注
This paper has been withdrawn by the author due to errors in figure 1