基于弗里恩-谢拉特坐标系的三维曲线结构分段用于部件分割
计算机视觉与模式识别
2025-07-15 v3 图像与视频处理
摘要
在医学影像中准确分割三维曲线结构 remains 挑战性,这些结构具有复杂几何形状,且缺乏多样化大规模数据集用于算法开发和评估。本文以树突分割为案例研究,提出了一种 novel 的弗里恩-谢拉特坐标系(Frenet-Serret Frame-based Decomposition)方法,该方法将三维曲线结构分解为全局 连续曲线(捕获整体形状)和柱面原语(编码局部几何属性)。该方法利用弗里恩-谢拉特坐标系和弧长参数化,以保留基本几何特征,同时降低表示复杂度,促进数据高效学习、分割精度和三维曲线结构的泛化。为严格评估该方法,我们引入两个数据集:CurviSeg 是用于三维曲线结构分割的合成数据集,验证了该方法的关键属性;DenSpineEM 是用于树突分割的基准数据集,包含来自三个公开电子显微镜数据集中 70 条树突的 4,476 个手动注释树突,覆盖多个脑区和物种。我们在 DenSpineEM 上的实验显示,该方法在跨区域和跨物种泛化方面表现卓越:在小鼠感觉皮层子集上训练的模型在小鼠视觉皮层(Dice 为 94.1%)和人类前额叶(Dice 为 81.8%)子集上实现了 91.9% Dice 的零样本分割。此外,我们在 IntrA 数据集上测试了该方法的通用性,获得了 77.08% Dice(比先前方法高出 5.29%)的脑内动脉瘤分割结果。这一发现表明,该方法有望用于跨 diverse medical imaging 领域的精确分析复杂曲线结构。
关键词
引用
@article{arxiv.2404.14435,
title = {Frenet-Serret Frame-based Decomposition for Part Segmentation of 3D Curvilinear Structures},
author = {Leslie Gu and Jason Ken Adhinarta and Mikhail Bessmeltsev and Jiancheng Yang and Yongjie Jessica Zhang and Wenjie Yin and Daniel Berger and Jeff Lichtman and Hanspeter Pfister and Donglai Wei},
journal= {arXiv preprint arXiv:2404.14435},
year = {2025}
}
备注
10 pages, 4 figures