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自由体积理论解释形态发生中非汇合组织的黏度反常行为

软凝聚态物质 2023-11-28 v2 统计力学 生物物理

摘要

近期一项关于斑马鱼囊胚形态发生的实验表明,非汇合胚胎组织的黏度 (η{\eta}) 在达到临界细胞堆积分数 (ϕS{\phi}S) 前急剧增长。在 ϕS{\phi}S 之前 η{\eta} 的上升类似于若干玻璃形成材料中的行为,这意味着细胞动力学迟缓或呈玻璃态。令人惊讶的是,在 ϕS{\phi}S 之上 η{\eta} 保持恒定。为确定 η{\eta}ϕ{\phi} 这种反常依赖关系的机制,我们使用基于智能体的致密非汇合二维组织模型进行了大量模拟。我们表明,细胞尺寸的 polydispersity(多分散性)以及细胞发生变形的倾向,导致在临界堆积分数之外每个细胞可用自由面积的饱和。自由空间的饱和不仅解释了 ϕS{\phi}S 之上黏度的平台区,还给出了平衡几何堆积与弛豫动力学急剧变化之间的关系。

关键词

引用

@article{arxiv.2211.14242,
  title  = {Free volume theory explains the unusual behavior of viscosity in a non-confluent tissue during morphogenesis},
  author = {Rajsekhar Das and Sumit Sinha and Xin Li and T. R. Kirkpatrick and D. Thirumalai},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2211.14242},
  year   = {2023}
}

备注

19 pages, 5 figures, accepted for publication in eLife