具有受限长程相互作用的酶 - 底物系统的场论
生物物理
2024-01-19 v1 统计力学
摘要
酶 - 底物动力学构成了许多生物分子过程的基础。底物结合与底物几何形状之间的相互作用可能导致酶结合事件之间产生长程相互作用。在此,我们研究了一个具有受限长程相互作用的酶 - 底物动力学通用模型,该相互作用由指数 描述。我们采用相干态路径积分和重整化群方法来计算酶结合分布的一阶矩和两点关联函数。我们表明,从空底物开始,平均占据数随时间遵循指数为 的幂律。关联函数呈代数衰减,具有两个不同的空间区域,其特征指数在短距离上为 ,在长距离上为 。这两个区域之间的交叉尺度与平均底物占据数成反比。我们的工作使得能够将结合酶位置的实验测量与其结合动力学及底物的空间构象联系起来。
引用
@article{arxiv.2401.09827,
title = {Field theory of enzyme-substrate systems with restricted long-range interactions},
author = {Fabrizio Olmeda and Steffen Rulands},
journal= {arXiv preprint arXiv:2401.09827},
year = {2024}
}