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基于深度异方差多任务网络从弱标签数据进行少样本脑分割

机器学习 2019-04-05 v1 图像与视频处理 机器学习

摘要

在应用于医学图像分割的监督学习中,对大量标签数据的需求通常不容置疑。尤其在脑解剖分割中,常使用数百或数千个弱标签体卷作为训练数据。本文首先观察到,对于许多脑结构,少量训练样本(n=9)使用 Freesurfer 6.0 弱标签加简单数据增强,即足以作为训练数据达到高性能,在 Adolescent Brain Cognitive Development 研究中约 4000 名 9-10 岁儿童的 T1 加权图像上,相较于 Freesurfer 在 28 个脑结构上实现了总体平均 Dice 系数 0.84±0.120.84 \pm 0.12。我们随后考察了两类异方差网络作为改进分类结果的方法。Kendall 与 Gal 的已有方案利用蒙特卡洛推断学习预测每个预测的方差,得到总体平均 Dice 为 0.85±0.140.85 \pm 0.14,并在 25 个脑结构上显示出统计显著改进。同时,一种直接学习样本被错标概率的新型异方差网络实现了总体平均 Dice 为 0.87±0.110.87 \pm 0.11,并在所考虑脑结构中除一个外均显示出统计显著改进。该网络相关的损失函数可解释为执行一种习得标签平滑的形式,即仅在被判为不确定的地方平滑标签。

关键词

引用

@article{arxiv.1904.02436,
  title  = {Few-shot brain segmentation from weakly labeled data with deep heteroscedastic multi-task networks},
  author = {Richard McKinley and Michael Rebsamen and Raphael Meier and Mauricio Reyes and Christian Rummel and Roland Wiest},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1904.02436},
  year   = {2019}
}