ezBIDS:面向主要数据存档与平台互操作性的神经影像数据引导式标准化工具
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2024-05-28 v1
摘要
数据标准化已成为神经影像研究人员依赖的数据共享与可重复性主要方法之一。数据标准化推广了一个通用框架,研究人员可借此利用他人的数据。然而,迄今为止,格式化符合社区最佳实践的数据集需要涉及编程的技术专长以及对文件格式与标准的相当了解。我们描述了 ezBIDS,一个将神经影像数据及关联元数据转换为脑影像数据结构(BIDS)标准的工具。ezBIDS 提供四项独特特性:(1)无需安装或编程要求。(2)同时处理影像与任务事件数据及元数据。(3)自动推断并引导以符合 BIDS。(4)多种数据管理选项:将 BIDS 数据下载至本地系统,或传输至 OpenNeuro.org 或 brainlife.io。总之,ezBIDS 既不需要编程熟练度也不需要 BIDS 知识,且是首个提供引导式标准化、支持任务事件转换以及与 OpenNeuro 和 brainlife.io 互操作的 BIDS 工具。
引用
@article{arxiv.2311.04912,
title = {ezBIDS: Guided standardization of neuroimaging data interoperable with major data archives and platforms},
author = {Daniel Levitas and Soichi Hayashi and Sophia Vinci-Booher and Anibal Heinsfeld and Dheeraj Bhatia and Nicholas Lee and Anthony Galassi and Guiomar Niso and Franco Pestilli},
journal= {arXiv preprint arXiv:2311.04912},
year = {2024}
}