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从电子健康档案用药指令中提取每日剂量:一种自动化方法及经验启示

计算与语言 2021-11-01 v2 信息检索

摘要

用药时间线已被证明能有效帮助医生可视化复杂的患者用药信息。许多此类设计的一个关键特征是对药物每日剂量及其随时间变化的纵向表示。然而,作为离散值的每日剂量通常并未提供,需从自由文本指令(Sig)中推导。现有每日剂量提取工作范围狭窄,仅针对临床笔记中单一药物的剂量提取。在此,我们提出一种结合基于深度学习的命名实体提取器与词典及正则表达式的自动化方法,为所有药物计算每日剂量,在专家生成的1000条Sig数据集上取得了0.98的精确率与0.95的召回率。我们还分析了专家生成的数据集,讨论了理解Sig中复杂信息的挑战,并提供了指导未来通用每日剂量计算任务的见解。

关键词

引用

@article{arxiv.2005.10899,
  title  = {Extracting Daily Dosage from Medication Instructions in EHRs: An Automated Approach and Lessons Learned},
  author = {Diwakar Mahajan and Jennifer J. Liang and Ching-Huei Tsou},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2005.10899},
  year   = {2021}
}

备注

10 pages, 4 figures, 9 tables