YTEX 与 MetaMap 在临床概念识别中的评估
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2014-02-10 v1 计算与语言
摘要
我们以 MetaMap 和 YTEX 为基础构建了两个独立的系统，以参与 2013 年 ShARe/CLEF eHealth Task 1，该任务旨在识别临床概念。未对这些系统进行直接修改，但使用了停用概念、停用概念文本和 UMLS 语义类型对输出概念进行了过滤。还利用一小套规则调整了概念边界，以提高严格任务上的精确率。总体而言，MetaMap 在严格任务上的表现优于 YTEX，这主要归因于其精确率提高了 20%。在宽松任务中，YTEX 在精确率和召回率上均表现更好，使其在测试数据上的整体 F-Score 比 MetaMap 高出 4.6%。我们的结果还表明，YTEX 在 UMLS CUI 映射上的准确率高出 1.3%。
引用
@article{arxiv.1402.1668,
title = {Evaluation of YTEX and MetaMap for clinical concept recognition},
author = {John David Osborne and Binod Gyawali and Thamar Solorio},
journal= {arXiv preprint arXiv:1402.1668},
year = {2014}
}
备注
6 pages, working notes to the ShareClef eHealth 2013 Shared Task