高维广义线性模型中的方差分量、遗传率与岭惩罚的估计
统计计算
2019-02-08 v1
摘要
针对高维线性回归模型,我们回顾并比较了随机斜率和误差的方差 与 的若干估计量。这些方差直接与岭回归惩罚 和遗传学中常用的遗传率指数 相关。我们还讨论了基于交叉验证(CV)或最大边际似然(MML)的直接与间接估计量。比较涵盖了协变量矩阵 (其中 )的若干情形,例如多重共线协变量与数据导出的协变量。此外,我们研究了模型偏离情形下的稳健性,如稀疏而非稠密效应以及非高斯误差。一个基于基因组协变量的体重增加数据示例证实了 MML 相较于 CV 的良好表现。我们给出了若干扩展。首先,扩展至高维线性混合效应模型,以 REML 作为 MML 的替代。其次,扩展至共轭贝叶斯设定,其被证明是一种良好的替代方案。第三,也是最为突出的,扩展至广义线性模型,我们通过将边际似然重写为 维积分,推导出一种计算高效的 MML 估计量。对于 Poisson 与 Binomial 岭回归,我们展示了所得 的 MML 估计量相对于 CV 的更优精度。我们提供了软件以实现本文所有结果的可复现。
引用
@article{arxiv.1902.02623,
title = {Estimation of variance components, heritability and the ridge penalty in high-dimensional generalized linear models},
author = {Jurre R. Veerman and Gwenael G. R. Leday and Mark A. van de Wiel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1902.02623},
year = {2019}
}