用于逆分子设计的等变能量引导SDE
化学物理
2023-03-02 v3 机器学习
生物大分子
摘要
逆分子设计在材料科学与药物发现中至关重要，所生成的分子应满足某些期望属性。本文中，我们提出等变能量引导随机微分方程（EEGSDE），一种在扩散模型下由能量函数引导的可控三维分子生成的灵活框架。形式上，我们证明只要能量函数对正交变换不变，EEGSDE便能自然利用三维分子构象中的几何对称性。在经验上，在设计的能量函数引导下，EEGSDE在面向量子属性与分子结构的逆分子设计上显著优于QM9上的基线。此外，EEGSDE能够通过线性组合相应能量函数生成具有多个目标属性的分子。
引用
@article{arxiv.2209.15408,
title = {Equivariant Energy-Guided SDE for Inverse Molecular Design},
author = {Fan Bao and Min Zhao and Zhongkai Hao and Peiyao Li and Chongxuan Li and Jun Zhu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2209.15408},
year = {2023}
}