基于流行病学信息的异质性感知图神经网络用于疫情预测
机器学习
2025-12-30 v2 社会与信息网络
摘要
在各种时空预测任务中,疫情预测在公共卫生管理中发挥着关键作用。近期研究表明,时空图神经网络(STGNN)在从疫情预测中提取异质时空模式方面具有巨大潜力。然而,这些方法大多简化地假设,两个具有相似观测特征的地点(如城市)在未来发展相似的感染数。在事实上,对于任何疾病,都存在其内在演化机制在不同地理位置和时间上的强异质性,这最终会导致两个“相似”地点感染数的差异。然而,这种机制性异质性由于存在大量影响因素如医疗资源可及性、病毒突变、 mobility 模式等,大多为时空且不可获取甚至不可观测,因而难以捕获。为此,我们提出了一种称为 HeatGNN 的异质性感知传播图神经网络—a 一种新型的疫情预测框架。通过将流行病学机理模型绑定到图神经网络中,HeatGNN 学习了不同地点的基于流行病学的地点嵌入,这些嵌入反映了它们随时间的传播机制。结合基于流行病学地点嵌入计算的时变机理亲和图,我们设计了一个编码地点之间机制异质性的异质性传播图网络,以提供额外的预测信号以促进准确预测。在三个基准数据集上的实验结果表明,HeatGNN 在各种强基线方法上均表现出色。此外,我们的效率分析验证了 HeatGNN 在不同数据集大小上的实际可行性。
引用
@article{arxiv.2411.17372,
title = {Epidemiology-informed Graph Neural Network for Heterogeneity-aware Epidemic Forecasting},
author = {Yufan Zheng and Wei Jiang and Tong Chen and Alexander Zhou and Nguyen Quoc Viet Hung and Choujun Zhan and Hongzhi Yin},
journal= {arXiv preprint arXiv:2411.17372},
year = {2025}
}
备注
14 pages, 6 figures, 3 tables