基于实验与模拟的 1 型菌毛的熵键合
生物物理
2020-04-17 v1
摘要
1 型菌毛是一种细菌丝状物,由长的卷曲蛋白质亚基链组成,亚基之间通过互补 -链的非共价键连接。其强度和结构稳定性对于尿道致病性大肠杆菌的锚定功能至关重要。最近,通过原子力显微镜(AFM)实验和导向分子动力学(SMD)模拟研究了菌毛 FimG 亚基的拉伸与解折叠[A. Alonso-Caballero et al., Nature Commun. 9, 2758 (2018)]。在这项工作中,我们进行了实验与模拟的定量比较,显示出在解折叠的底层功值方面具有良好的一致性。然后利用模拟结果估算链中 FimG 从相邻亚基 FimF 的互补链上脱离的自由能差。最后,我们表明,导致链高稳定性的亚基解折叠与脱离的巨大自由能差完全源于熵。
引用
@article{arxiv.2003.10483,
title = {Entropic bonding of the type 1 pilus from experiment and simulation},
author = {Fabiano Corsetti and Alvaro Alonso-Caballero and Simon Poly and Raul Perez-Jimenez and Emilio Artacho},
journal= {arXiv preprint arXiv:2003.10483},
year = {2020}
}
备注
9 pages, 5 figures