通过染色解卷积与重染 HE-HES 实现 HE 染色切片上的胶原量化
图像与视频处理
2024-10-28 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
在组织学中，细胞外基质中胶原的存在对癌症恶性程度兼具诊断与预后价值，并可通过在常规苏木精-伊红（HE）染色中添加红花素（S）来突显。然而，除法国实验室外，由于额外成本以及病理学家习惯于 HE，红花素通常不被添加。本文中，我们展示仅从 HE 图像量化胶原含量并数字生成 HES 图像是可行的。为此，我们训练了一个 UNet 从 HE 图像预测红花素密度。我们构建了一个配准的重染 HE-HES 切片数据集，并利用 HES 图像上的染色解卷积提取红花素浓度作为真值。我们的模型在 3 折测试集上达到 0.0668 0.0002 的平均绝对误差（红花素取值介于 0 与 1 之间）。我们希望我们的方法能在降低实验室试剂成本的同时助力改进临床工作流。
引用
@article{arxiv.2211.09566,
title = {Enabling Collagen Quantification on HE-stained Slides Through Stain Deconvolution and Restained HE-HES},
author = {Guillaume Balezo and Christof A. Bertram and Cyprien Tilmant and Stéphanie Petit and Saima Ben Hadj and Rutger H. J. Fick},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.09566},
year = {2024}
}
备注
This work has been submitted to the IEEE for possible publication