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使用 SpatialConfiguration-Net 且具有低 GPU 内存需求的高效多器官分割

图像与视频处理 2022-01-05 v2 计算机视觉与模式识别 机器学习

摘要

尽管存在许多能够在许多医学数据集上表现良好的语义分割方法,但它们通常并非为直接应用于临床实践而设计。两个主要问题是:对具有不同视觉外观的未见数据(例如使用不同扫描仪获取的图像)的泛化能力,以及在计算时间和所需图形处理器(GPU)内存方面的效率。在本工作中,我们采用了一个基于 SpatialConfiguration-Net (SCN) 的多器官分割模型,该模型整合了已标记器官之间空间配置的先验知识,以消除网络输出中的虚假响应。此外,我们修改了分割模型的架构,在不严重影响预测质量的前提下,尽可能减少其内存占用。最后,我们实现了一个最小化的推理脚本,并对其执行时间和所需 GPU 内存均进行了优化。

关键词

引用

@article{arxiv.2111.13630,
  title  = {Efficient Multi-Organ Segmentation Using SpatialConfiguration-Net with Low GPU Memory Requirements},
  author = {Franz Thaler and Christian Payer and Horst Bischof and Darko Stern},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2111.13630},
  year   = {2022}
}